王允子师在南阳学院中以左慈元放的身份隐藏自己的原因是为了隐藏其王允的真实身份。根据搜索结果中的信息，王允子师继承了三国名将王允之名，是南阳四天王之一。他一开始假装成左慈元放，并装出玩世不恭的花花公子形象，实际上是为了隐藏王允的真实身份。这一策略可能是出于对个人安全的考虑，或是为了在南阳学院中保持低调，避免引起不必要的注意或冲突。通过这种方式，王允子师能够在背后默默地进行自己的计划和活动，同时保护自身不受敌对势力的影响。
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