维也纳大学在中世纪时期发展成为神圣罗马帝国最大的大学，主要得益于以下几个因素：
建立背景：维也纳大学成立于1365年，是德语区国家最古老的大学之一1。它的建立与哈布斯堡家族成为神圣罗马帝国皇帝有关，鲁道夫一世在1273年成为神圣罗马帝国皇帝，并在1365年建立了维也纳大学2。
政治与社会环境：在中世纪，大学在天主教会的支持下诞生，并在政教分离的夹缝中不断发展3。维也纳大学作为神圣罗马帝国的大学，受到了帝国和教会的重视。
学术发展：在人文主义时期，维也纳大学有超过6,000名学生，使其成为神圣罗马帝国最大的大学1。这表明维也纳大学在学术上有着显著的发展和吸引力。
文化与教育中心：维也纳长期担任神圣罗马帝国和奥地利帝国的首都，在文化和教育方面有着重要的地位4。这为维也纳大学的发展提供了良好的环境。
德语区的学术中心：维也纳大学是多瑙河地区的学术中心，产生了21位诺贝尔奖得主，显示了其在学术研究和教育上的重要地位5。
综上所述，维也纳大学之所以能在中世纪时期发展成为神圣罗马帝国最大的大学，是多方面因素共同作用的结果，包括其建立的历史背景、政治与社会环境的支持、学术发展、文化教育中心的地位以及作为德语区学术中心的影响力。