《聖塔菲協議》的原始文件不复存在的原因可能与历史文件的保存条件和时间有关。根据维基百科的资料，现存最早的摹本出现在1493年巴塞罗那国王发布的确认书中，而该版本协议省略了“亚洲”一词。这表明原始文件可能由于时间的流逝、保存条件不佳或历史上的意外事件（如火灾、战争等）而遗失。由于没有更多的具体信息，我们无法确定确切的原因，但可以推测是多种因素综合作用的结果。
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