在魏晋南北朝时期，庄园经济成为地主和寺院的主要经济形式的原因主要有以下几点：
社会动荡与战乱频繁：魏晋南北朝时期长达三百多年的战乱，导致大量饥寒交迫、流离失所的灾民，他们迫切需要依附于地主或寺院以求生存，从而促进了庄园经济的发展[1]。
经济特权：寺院经济发达的一部分原因是它是一种特权经济。寺院享受经济特权，如依附民制度合法化，寺院可以拥有僧祗户和佛图户等依附民，这些依附民为寺院提供了劳动力和经济来源[2]。
地主庄园制的发展：徐扬杰先生认为，地主庄园制的发展和自然经济的再次强化，是这一时期经济上的重要特点，也是世家大族式家族组织的重要经济基础[3]。
破产小农的依附：在魏晋南北朝时期，破产的小农不得不依附士族庄园主，成为缺乏人身自由的部曲或农奴，这种依附关系促进了庄园经济的发展[4]。
寺院经济的兴起：魏晋南北朝时期，由于建立国家地主政权和门阀政治的盛行，地主庄园经济发展较大，是我国地主经济的一个重要发展阶段，同时也带动了寺庙经济的兴起[5]。
土地制度的变化：有的农民份地距离自营地相当遥远，根本无法去服劳役，所以许多庄园的农民没有或者很少有劳役负担，只向领主交纳一些实物或货币，这种关系就像是一种租佃关系，促进了庄园经济的发展[6]。
寺院地主经济的形成：魏晋南北朝时期，动荡复杂的社会环境，不仅孕育了南北方不同特色的世俗地主经济，而且寺院地主经济作为时代的产儿也来到了世间[7]。
综上所述，魏晋南北朝时期庄园经济之所以成为地主和寺院的主要经济形式，是由于社会动荡、经济特权、庄园制发展、破产小农依附、寺院经济兴起、土地制度变化以及寺院地主经济形成等多方面因素共同作用的结果。
[1] 中国古代金融的现代价值 - 论文- 科学网 [2] 魏晋南北朝寺院经济状况及原因分析－－华人学佛网 [3] 社会与经济_中国人民大学清史研究所 [4] 北大经院学者| 周建波：古代如何调节收入分配差距 [5] 谈谈古代各朝代寺庙经济兴衰的历史-寺庙设计施工一站式 [6] 论地主经济——《封建经济政治概论》第三章 - 中国经济史论坛 [7] 试论魏晋南北朝寺院地主经济(任怀国) - 佛教历史文化研究