秦二世皇帝元年到三年间，即公元前209年至公元前207年，秦朝经历了以下重大历史事件：
秦二世即位与大赦：秦二世胡亥在秦始皇死后即位，并在元年十月四日（儒略历前210年11月21日）大赦天下[1]。
陈胜吴广起义：秦二世元年七月，戍卒陈胜等在故荆地起义，建立了“张楚”政权，标志着秦末农民战争的开始[1][2]。
焚书坑儒：秦朝为了加强思想控制，进行了焚书坑儒事件，这是中国古代历史上的一次重大文化灾难[3]。
巨鹿之战：秦二世三年，项羽在巨鹿之战中大败秦军，这是秦朝灭亡前的关键战役之一[4]。
秦朝灭亡：前207年十月，秦王子婴向刘邦投降，秦朝灭亡。随后项羽抵达关中，杀死秦王子婴，并焚烧咸阳宫[1]。
这些事件共同导致了秦朝的快速崩溃和灭亡，结束了中国历史上第一个统一的中央集权制国家。
[1] 秦二世- 维基百科，自由的百科全书
[2] 秦朝从立国到灭亡仅十五年，却先后发生了十一件重大历史事件 - 搜狐
[3] 大事件盘点：中国秦朝历史大事件- 事件簿
[4] 中国历代纪元表/歷史地圖 - Ole Miss