贺茂斋院在平安时代末期逐渐衰落的原因与当时日本社会政治结构的转变密切相关。根据维基百科的资料，平安时代是日本古代向中世转变的过渡期，这一时期庄园公领制的兴起对贺茂斋院产生了影响。庄园公领制的实施使得地方领主的权力增强，而中央权力相对削弱，导致贺茂斋院作为中央机构的影响力下降。同时，随着武士阶层的崛起和庄园制的普及，贺茂斋院在政治、经济和宗教上的作用逐渐被边缘化，最终导致其衰落。这一过程是日本从古代向中世纪过渡的社会变革的一部分，反映了当时社会结构和权力分布的重大变化。
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