奇里乞亚亚美尼亚王国最终被马穆鲁克苏丹国灭亡的原因主要有以下几点：

1. 外部压力：奇里乞亚亚美尼亚王国面临着来自埃及马穆鲁克王朝的长期进犯。马穆鲁克王朝的军事力量强大，对奇里乞亚亚美尼亚王国构成了持续的威胁。根据百度百科，“面对埃及马穆鲁克王朝的长期进犯，加上王国的吕西尼安王朝(Lusignan Dynasty)陷入宗教内乱，王国最终于1375年灭亡。”奇里乞亚亚美尼亚王国_百度百科。

2. 内部宗教冲突：奇里乞亚亚美尼亚王国内部的吕西尼安王朝(Lusignan Dynasty)陷入了宗教内乱，这削弱了王国的内部稳定性和抵抗力。如全历史所述，“在内部宗教冲突和马木留克不断进攻下，王国最终于1375年灭亡。”奇里乞亚亚美尼亚王国 - 全知识。

3. 盟友的丧失：13-14世纪，各十字军国家逐渐崩溃、蒙古人伊斯兰化，使奇里乞亚失去盟友。这导致奇里乞亚亚美尼亚王国在面对马穆鲁克的攻击时缺乏外部支持。如全历史所述，“13-14世纪，各十字军国家逐渐崩溃、蒙古人伊斯兰化，使奇里乞亚失去盟友。”奇里乞亚亚美尼亚王国 - 全知识。

4. 经济和军事上的孤立：与欧洲国家之间的经济和军事交往减少，使得奇里乞亚亚美尼亚王国在军事上变得更加孤立无援。这一点在百度百科中有所提及，“和欧洲国家之间经济和军事上的交往，给奇里乞亚亚美尼...”奇里乞亚亚美尼亚王国_百度百科。

综上所述，奇里乞亚亚美尼亚王国的灭亡是外部军事压力、内部宗教冲突、盟友丧失以及经济军事孤立等多重因素共同作用的结果。