朱儁在董卓掌权后选择逃奔荆州的原因可以从以下几个方面来理解：
朱儁与董卓的关系：朱儁是东汉末年的名将，曾参与平定黄巾起义。董卓掌权后，有意任命朱儁为太仆，但朱儁婉拒了这一任命1。这表明朱儁并不愿意与董卓合作，可能是因为他不认同董卓的暴政和专权。
朱儁的政治立场：朱儁后来被陶谦等人推举为太师，参与讨伐李傕，逢迎汉献帝。这显示了朱儁忠于汉室，反对董卓篡权的政治立场1。
董卓的暴政：董卓掌权期间，其暴政和专权行为引起了广泛的不满和反抗。朱儁作为东汉末年的名将，很可能因为不满董卓的统治而选择逃离。
荆州的地理位置和政治环境：荆州在当时是一个较为安全的地方，刘表作为荆州牧，相对温和且有一定的政治影响力。朱儁逃往荆州，可能是寻求一个相对稳定和安全的环境，同时也可能是为了寻找机会继续反抗董卓的统治。
综上所述，朱儁逃奔荆州是因为不愿意与董卓合作，忠于汉室，同时寻求一个安全的环境以继续他的反抗活动。